Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arf3P61205 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf3P61205 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf3P61205 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf3P61205 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf3P61205 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf3P61205 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms