Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ube2kP61087 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2kP61087 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2kP61087 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2kP61087 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2kP61087 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2kP61087 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2kP61087 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2kP61087 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2kP61087 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2kP61087 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2kP61087 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2kP61087 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2kP61087 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2kP61087 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2kP61087 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2kP61087 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2kP61087 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2kP61087 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2kP61087 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2kP61087 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2kP61087 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2kP61087 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2kP61087 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2kP61087 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2kP61087 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2kP61087 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2kP61087 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2kP61087 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2kP61087 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2kP61087 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2kP61087 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2kP61087 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2kP61087 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2kP61087 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2kP61087 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2kP61087 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2kP61087 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2kP61087 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2kP61087 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2kP61087 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2kP61087 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2kP61087 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2kP61087 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2kP61087 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2kP61087 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2kP61087 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2kP61087 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2kP61087 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2kP61087 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2kP61087 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2kP61087 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2kP61087 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms