Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap25P60879 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap25P60879 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap25P60879 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap25P60879 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap25P60879 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap25P60879 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap25P60879 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snap25P60879 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms