Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps5P59438 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps5P59438 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps5P59438 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps5P59438 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps5P59438 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps5P59438 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps5P59438 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps5P59438 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps5P59438 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps5P59438 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms