Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup43P59235 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup43P59235 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup43P59235 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup43P59235 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup43P59235 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup43P59235 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup43P59235 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup43P59235 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms