Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Csrnp3P59055 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csrnp3P59055 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrnp3P59055 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms