Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strn4P58404 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn4P58404 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn4P58404 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn4P58404 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strn4P58404 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Strn4P58404 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Strn4P58404 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Strn4P58404 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strn4P58404 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strn4P58404 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn4P58404 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strn4P58404 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strn4P58404 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms