Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrpa1P57784 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snrpa1P57784 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrpa1P57784 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrpa1P57784 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrpa1P57784 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrpa1P57784 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrpa1P57784 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrpa1P57784 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrpa1P57784 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrpa1P57784 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrpa1P57784 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrpa1P57784 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrpa1P57784 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snrpa1P57784 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snrpa1P57784 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms