Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Samsn1P57725 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samsn1P57725 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms