Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Cldn18P56857 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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