Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtskP55097 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtskP55097 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtskP55097 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtskP55097 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtskP55097 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtskP55097 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtskP55097 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CtskP55097 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtskP55097 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtskP55097 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtskP55097 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtskP55097 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtskP55097 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtskP55097 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtskP55097 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtskP55097 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtskP55097 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtskP55097 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtskP55097 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtskP55097 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtskP55097 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtskP55097 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CtskP55097 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtskP55097 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CtskP55097 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtskP55097 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtskP55097 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtskP55097 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtskP55097 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtskP55097 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtskP55097 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtskP55097 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CtskP55097 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtskP55097 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtskP55097 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtskP55097 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtskP55097 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtskP55097 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtskP55097 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CtskP55097 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CtskP55097 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtskP55097 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CtskP55097 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtskP55097 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtskP55097 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtskP55097 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtskP55097 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtskP55097 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtskP55097 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtskP55097 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms