Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PitpnbP53811 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms