Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PctpP53808 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PctpP53808 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PctpP53808 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PctpP53808 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PctpP53808 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PctpP53808 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PctpP53808 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PctpP53808 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PctpP53808 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PctpP53808 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PctpP53808 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PctpP53808 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PctpP53808 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PctpP53808 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PctpP53808 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PctpP53808 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PctpP53808 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PctpP53808 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PctpP53808 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PctpP53808 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PctpP53808 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PctpP53808 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PctpP53808 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PctpP53808 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PctpP53808 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PctpP53808 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PctpP53808 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PctpP53808 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PctpP53808 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PctpP53808 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PctpP53808 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PctpP53808 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PctpP53808 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PctpP53808 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PctpP53808 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PctpP53808 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PctpP53808 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PctpP53808 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PctpP53808 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PctpP53808 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PctpP53808 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PctpP53808 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PctpP53808 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PctpP53808 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PctpP53808 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PctpP53808 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PctpP53808 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PctpP53808 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PctpP53808 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PctpP53808 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PctpP53808 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PctpP53808 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PctpP53808 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PctpP53808 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PctpP53808 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PctpP53808 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PctpP53808 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PctpP53808 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PctpP53808 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PctpP53808 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PctpP53808 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PctpP53808 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PctpP53808 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PctpP53808 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PctpP53808 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PctpP53808 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PctpP53808 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PctpP53808 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PctpP53808 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PctpP53808 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PctpP53808 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PctpP53808 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PctpP53808 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms