Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux1P53564 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux1P53564 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux1P53564 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cux1P53564 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux1P53564 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux1P53564 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux1P53564 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux1P53564 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux1P53564 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux1P53564 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cux1P53564 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms