Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms