Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms