Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms