Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ApodP51910 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApodP51910 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ApodP51910 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ApodP51910 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ApodP51910 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ApodP51910 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ApodP51910 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApodP51910 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApodP51910 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApodP51910 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApodP51910 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ApodP51910 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApodP51910 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApodP51910 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApodP51910 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApodP51910 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApodP51910 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApodP51910 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApodP51910 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApodP51910 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApodP51910 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApodP51910 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApodP51910 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApodP51910 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApodP51910 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApodP51910 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ApodP51910 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApodP51910 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApodP51910 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApodP51910 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApodP51910 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApodP51910 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApodP51910 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApodP51910 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApodP51910 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ApodP51910 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ApodP51910 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ApodP51910 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ApodP51910 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ApodP51910 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ApodP51910 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ApodP51910 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ApodP51910 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ApodP51910 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ApodP51910 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ApodP51910 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ApodP51910 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ApodP51910 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ApodP51910 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ApodP51910 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ApodP51910 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ApodP51910 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ApodP51910 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ApodP51910 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ApodP51910 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ApodP51910 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ApodP51910 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ApodP51910 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ApodP51910 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ApodP51910 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ApodP51910 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ApodP51910 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ApodP51910 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ApodP51910 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ApodP51910 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ApodP51910 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ApodP51910 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ApodP51910 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ApodP51910 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ApodP51910 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ApodP51910 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ApodP51910 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ApodP51910 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ApodP51910 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApodP51910 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApodP51910 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApodP51910 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApodP51910 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApodP51910 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApodP51910 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApodP51910 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApodP51910 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApodP51910 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApodP51910 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApodP51910 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApodP51910 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApodP51910 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApodP51910 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApodP51910 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApodP51910 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApodP51910 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ApodP51910 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ApodP51910 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ApodP51910 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ApodP51910 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ApodP51910 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ApodP51910 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ApodP51910 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ApodP51910 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms