Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apobec1P51908 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms