Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LumP51885 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LumP51885 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LumP51885 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LumP51885 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LumP51885 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LumP51885 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LumP51885 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LumP51885 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LumP51885 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LumP51885 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LumP51885 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LumP51885 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LumP51885 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LumP51885 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LumP51885 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LumP51885 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LumP51885 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LumP51885 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LumP51885 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LumP51885 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LumP51885 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LumP51885 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LumP51885 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LumP51885 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LumP51885 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LumP51885 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LumP51885 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LumP51885 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LumP51885 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LumP51885 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LumP51885 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LumP51885 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LumP51885 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LumP51885 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LumP51885 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LumP51885 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LumP51885 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LumP51885 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LumP51885 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LumP51885 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LumP51885 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LumP51885 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LumP51885 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LumP51885 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LumP51885 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LumP51885 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LumP51885 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LumP51885 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LumP51885 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LumP51885 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LumP51885 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LumP51885 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LumP51885 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LumP51885 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LumP51885 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LumP51885 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LumP51885 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LumP51885 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LumP51885 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LumP51885 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LumP51885 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LumP51885 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LumP51885 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LumP51885 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LumP51885 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LumP51885 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LumP51885 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LumP51885 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LumP51885 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LumP51885 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LumP51885 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LumP51885 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LumP51885 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LumP51885 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LumP51885 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LumP51885 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LumP51885 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LumP51885 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LumP51885 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms