Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms