Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpbP50405 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpbP50405 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpbP50405 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpbP50405 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpbP50405 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpbP50405 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SftpbP50405 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpbP50405 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SftpbP50405 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms