Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd7P50283 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd7P50283 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd7P50283 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd7P50283 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd7P50283 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd7P50283 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd7P50283 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd7P50283 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd7P50283 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms