Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms