Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb42P49222 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb42P49222 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb42P49222 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb42P49222 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb42P49222 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb42P49222 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb42P49222 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb42P49222 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb42P49222 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb42P49222 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb42P49222 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb42P49222 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb42P49222 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb42P49222 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb42P49222 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb42P49222 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb42P49222 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb42P49222 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb42P49222 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epb42P49222 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb42P49222 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb42P49222 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb42P49222 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb42P49222 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms