Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brca1P48754 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brca1P48754 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brca1P48754 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brca1P48754 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Brca1P48754 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brca1P48754 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brca1P48754 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brca1P48754 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brca1P48754 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms