Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GdnfP48540 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GdnfP48540 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GdnfP48540 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms