Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcd1P48410 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms