Protein–RNA interactions for Protein: P47880

Igfbp6, Insulin-like growth factor-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp6P47880 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Igfbp6P47880 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igfbp6P47880 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms