Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nedd4P46935 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd4P46935 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms