Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms