Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms