Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rpl28P41105 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rpl28P41105 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rpl28P41105 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rpl28P41105 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rpl28P41105 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rpl28P41105 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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