Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VhlP40338 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VhlP40338 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VhlP40338 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VhlP40338 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VhlP40338 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VhlP40338 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VhlP40338 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VhlP40338 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VhlP40338 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VhlP40338 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VhlP40338 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VhlP40338 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VhlP40338 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VhlP40338 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VhlP40338 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VhlP40338 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VhlP40338 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VhlP40338 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VhlP40338 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VhlP40338 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VhlP40338 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VhlP40338 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VhlP40338 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VhlP40338 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VhlP40338 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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