Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ThpoP40226 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ThpoP40226 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ThpoP40226 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ThpoP40226 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ThpoP40226 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ThpoP40226 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms