Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf2P39429 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf2P39429 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf2P39429 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf2P39429 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf2P39429 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf2P39429 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf2P39429 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf2P39429 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf2P39429 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf2P39429 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf2P39429 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms