Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TtlP38585 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TtlP38585 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TtlP38585 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TtlP38585 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TtlP38585 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TtlP38585 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TtlP38585 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TtlP38585 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TtlP38585 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TtlP38585 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TtlP38585 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtlP38585 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtlP38585 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtlP38585 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtlP38585 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtlP38585 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtlP38585 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtlP38585 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtlP38585 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TtlP38585 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TtlP38585 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtlP38585 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtlP38585 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtlP38585 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtlP38585 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtlP38585 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtlP38585 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtlP38585 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TtlP38585 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TtlP38585 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TtlP38585 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TtlP38585 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TtlP38585 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TtlP38585 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TtlP38585 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TtlP38585 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TtlP38585 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TtlP38585 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TtlP38585 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TtlP38585 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TtlP38585 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TtlP38585 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TtlP38585 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TtlP38585 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtlP38585 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtlP38585 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtlP38585 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtlP38585 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtlP38585 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtlP38585 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TtlP38585 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtlP38585 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TtlP38585 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtlP38585 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtlP38585 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtlP38585 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtlP38585 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtlP38585 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtlP38585 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtlP38585 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtlP38585 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TtlP38585 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TtlP38585 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TtlP38585 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TtlP38585 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TtlP38585 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TtlP38585 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TtlP38585 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TtlP38585 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TtlP38585 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TtlP38585 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TtlP38585 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TtlP38585 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtlP38585 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtlP38585 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtlP38585 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms