Protein–RNA interactions for Protein: P37237

Fgf8, Fibroblast growth factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf8P37237 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf8P37237 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf8P37237 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf8P37237 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf8P37237 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf8P37237 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fgf8P37237 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf8P37237 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf8P37237 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf8P37237 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf8P37237 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf8P37237 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf8P37237 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf8P37237 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf8P37237 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fgf8P37237 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf8P37237 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf8P37237 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf8P37237 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fgf8P37237 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf8P37237 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms