Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab20P35295 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab20P35295 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab20P35295 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab20P35295 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab20P35295 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab20P35295 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab20P35295 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab20P35295 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab20P35295 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab20P35295 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab20P35295 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms