Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3dP35276 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3dP35276 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3dP35276 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3dP35276 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3dP35276 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3dP35276 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3dP35276 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3dP35276 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3dP35276 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3dP35276 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3dP35276 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3dP35276 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3dP35276 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3dP35276 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3dP35276 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3dP35276 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3dP35276 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3dP35276 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3dP35276 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3dP35276 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab3dP35276 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3dP35276 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3dP35276 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3dP35276 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3dP35276 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3dP35276 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3dP35276 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3dP35276 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3dP35276 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3dP35276 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3dP35276 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3dP35276 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3dP35276 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3dP35276 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3dP35276 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3dP35276 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3dP35276 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3dP35276 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3dP35276 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3dP35276 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3dP35276 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3dP35276 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3dP35276 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3dP35276 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3dP35276 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab3dP35276 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3dP35276 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3dP35276 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3dP35276 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3dP35276 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3dP35276 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3dP35276 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3dP35276 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3dP35276 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms