Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nedd1P33215 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms