Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Notch4P31695 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Notch4P31695 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Notch4P31695 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Notch4P31695 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Notch4P31695 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Notch4P31695 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Notch4P31695 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Notch4P31695 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Notch4P31695 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Notch4P31695 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Notch4P31695 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Notch4P31695 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Notch4P31695 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms