Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms