Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms