Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc10P31257 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms