Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VtnP29788 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VtnP29788 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VtnP29788 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VtnP29788 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VtnP29788 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VtnP29788 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VtnP29788 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VtnP29788 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VtnP29788 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VtnP29788 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VtnP29788 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VtnP29788 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VtnP29788 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VtnP29788 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VtnP29788 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VtnP29788 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VtnP29788 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VtnP29788 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VtnP29788 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VtnP29788 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VtnP29788 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VtnP29788 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VtnP29788 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VtnP29788 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VtnP29788 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VtnP29788 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VtnP29788 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VtnP29788 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VtnP29788 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VtnP29788 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VtnP29788 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VtnP29788 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VtnP29788 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VtnP29788 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VtnP29788 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VtnP29788 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VtnP29788 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VtnP29788 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VtnP29788 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VtnP29788 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VtnP29788 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VtnP29788 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VtnP29788 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VtnP29788 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VtnP29788 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VtnP29788 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VtnP29788 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VtnP29788 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VtnP29788 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VtnP29788 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VtnP29788 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VtnP29788 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VtnP29788 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VtnP29788 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VtnP29788 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VtnP29788 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VtnP29788 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VtnP29788 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VtnP29788 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VtnP29788 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VtnP29788 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VtnP29788 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VtnP29788 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VtnP29788 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VtnP29788 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VtnP29788 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VtnP29788 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VtnP29788 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VtnP29788 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VtnP29788 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VtnP29788 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VtnP29788 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VtnP29788 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VtnP29788 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VtnP29788 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VtnP29788 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VtnP29788 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VtnP29788 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VtnP29788 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VtnP29788 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VtnP29788 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VtnP29788 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VtnP29788 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VtnP29788 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VtnP29788 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VtnP29788 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VtnP29788 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VtnP29788 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VtnP29788 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VtnP29788 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VtnP29788 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VtnP29788 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VtnP29788 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VtnP29788 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VtnP29788 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VtnP29788 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VtnP29788 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VtnP29788 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VtnP29788 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms