Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcdP28867 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms