Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mmp3P28862 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Mmp3P28862 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mmp3P28862 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mmp3P28862 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mmp3P28862 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mmp3P28862 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp3P28862 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp3P28862 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp3P28862 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp3P28862 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp3P28862 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp3P28862 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp3P28862 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp3P28862 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp3P28862 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp3P28862 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp3P28862 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mmp3P28862 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mmp3P28862 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms