Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxrgP28705 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxrgP28705 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxrgP28705 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxrgP28705 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxrgP28705 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxrgP28705 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxrgP28705 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RxrgP28705 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxrgP28705 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxrgP28705 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms