Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DcnP28654 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DcnP28654 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DcnP28654 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DcnP28654 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DcnP28654 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DcnP28654 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DcnP28654 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DcnP28654 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DcnP28654 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DcnP28654 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DcnP28654 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DcnP28654 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DcnP28654 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DcnP28654 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DcnP28654 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DcnP28654 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DcnP28654 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DcnP28654 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DcnP28654 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DcnP28654 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DcnP28654 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DcnP28654 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DcnP28654 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DcnP28654 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DcnP28654 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DcnP28654 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DcnP28654 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DcnP28654 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DcnP28654 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DcnP28654 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DcnP28654 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DcnP28654 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DcnP28654 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DcnP28654 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DcnP28654 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DcnP28654 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DcnP28654 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DcnP28654 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DcnP28654 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DcnP28654 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DcnP28654 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DcnP28654 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DcnP28654 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DcnP28654 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DcnP28654 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DcnP28654 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DcnP28654 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DcnP28654 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DcnP28654 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DcnP28654 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DcnP28654 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DcnP28654 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DcnP28654 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DcnP28654 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms